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• Bericht über die Auseinandersetzung um das dem Bischof von Basel gewidmete Vorwort des Nicolaus Stupanus zur 1580 bei Pietro Perna erschienenen zweiten [...] Amerbach, Basilius [1533-1591] nach 1580 Universitätsbibliothek Basel, C VIa 46:S.665-666

• Notizen über die Verwaltung des Silberbergischen Legates durch den Rektor der Universität Amerbach, Basilius [1533-1591] [Basel], zwischen 1561 und 1588 Universitätsbibliothek Basel, C VIa 17-19:S.1a-4a

• 11 : Pläne und Notizen betreffend das römische Theater von Augst Amerbach, Basilius [1533-1591] ; Amerbach, Basilius [1533-1591] ; Vischer, Wilhelm [1808-1874] ; Bock, Hans [ca.1550-1623] Basel, 1588-1590 Universitätsbibliothek Basel, O IV 11

• Aufzeichnungen zu den kriegerischen und rechtlichen Auseinandersetzungen um Albrecht II. Alcibiades, Markgraf von Brandburg-Kulmbach, im Zweiten Markg [...] Amerbach, Bonifacius [1495-1562] um 1556 Universitätsbibliothek Basel, C VIa 31:fol.124-126

• Eingabe an den Basler Rat betr. die Kompetenz der akademischen Gerichtsbarkeit, aus Anlass des tödlichen Unfalles eines Studenten Amerbach, Bonifacius [1495-1562] ; Basel [Basel], 22. Septembris 1555 Universitätsbibliothek Basel, C VIa 31:fol.190

• Glaubensbekenntnis von Bonifacius Amerbach bezüglich der Abendmahlslehre Amerbach, Bonifacius [1495-1562] [Basel], 21. Febr. 1534 Universitätsbibliothek Basel, C VIa 31:fol.132-133

• Tagebuchartige Notizen, vom 25. April bis 22. November 1531 Amerbach, Bonifacius [1495-1562] Basel, 25.4.-22.11.1531 Universitätsbibliothek Basel, C VIa 90:4

• Entwurf der Statuten für die Erasmusstiftung Amerbach, Bonifacius [1495-1562] ; Salzmann, Adelberg [?-1548] [Basel], nach 1536 Universitätsbibliothek Basel, C VIa 71:Bl.64-73

• [Reformationsgeschichte] Bullinger, Heinrich [1504-1575] Zürych [Zürich], 1564 Zentralbibliothek Zürich, Ms A 17

• [Reformationsgeschichte] Bullinger, Heinrich [1504-1575] Zürych [Zürich], 1564 Zentralbibliothek Zürich, Ms A 16